本區古為台江內海，台江內海為17世紀台灣南部的一座大潟湖，簡稱台江。此湖位於台南海岸邊，是為台南市外海沙洲與海岸線中間所圍繞而成，長度約為數十公里。而內海中最大島嶼為大員。
荷蘭人在17世紀抵達時，今臺灣的西南部仍為成群羅列的洲潟海岸。進入清領時期，潟湖因曾文溪改道等因素而日漸淤積。原台江內海淤積後，最普遍的用途是闢為魚塭。在日治時期時，抵達海濱的二鯤鯓砲臺（億載金城）尚需要竹筏。但台南市政府則於1990年代開發第五期重劃區，填平魚塭及遷移市政府至此後，目前已成一片市區至億載金城為止。
台江內海較大的遺跡是四草湖及鯤鯓湖。前者匯流鹽水溪、竹筏港、運鹽古運河、嘉南大排等河川，在安平及北汕尾之間出海，也是昔日安平舊港的所在地；後者則於戰後改建成為安平新港。
§臺江地名考
對照西方人1623年所繪大員港圖，「魍港、加老灣、大員…」大抵是圍繞在今天臺南市西海岸一帶的沙汕，這些沙汕所包圍的內海，形成一個「大灣」，狀似鯨背、龜殼，成為航海者的靠岸、避風港。這個大灣，清雍正年間才命名為臺江，始見於1722年藍鼎元所寫的《東征集》。
乾隆十一年（1744年），范咸《重修臺灣府志》正式將「臺江」地名收錄在府志中，南至七鯤鯓，北至蕭壠、茅港尾。
資料來源：摘錄自吳茂成著《臺江內海及其庄社》
§臺江水系
臺江多溪多水。
溪有曾文溪、鹽水溪、鹿耳門溪，水就屬水圳最美，總長87公里，四通八達，滋潤這片菅芒地，可說是臺江水路長城。
道光三年（1823年）七月，當時稱為灣裡溪的曾文溪，因一場暴雨洪潮，自菅寮第一次改道，新浮埔溪就是曾文溪第一次改道後的殘跡。
新浮埔溪發源於今日的菅寮、海寮的曾文溪排水線，向西南經公親寮、新寮，穿過十二佃之後，在公塭子南方，今日成大水工所東側南轉，斜從本淵寮、海尾寮前的溼地、魚塭處，匯集本淵寮排水線、西總排水線、海尾寮排水線，過今日西濱公路之後，一起在海尾寮西側的下六分、九分子、圓塭合流，注入四草湖，亦即大港口。
曾文溪排水線的流路，在成大水工所東側南轉，形成大曲流，將近九十度，西北方不遠處的北汕尾路，即是鹿耳門溪，昔日被鹽田隔開。
1904年的臺南與鹽水港兩廳的分界線，應該是沿著新浮埔溪而設。公親寮到十二佃之間的河道，則是伴隨著公學路而流，除了十二佃及中崙在臺南廳內之外，菅寮、海寮、新吉及公塭、溪南寮、學甲寮皆在鹽水港廳境，也就是在舊曾文溪河道的北岸。
新浮埔溪另一支西流入於蠔売港，從《臺灣保圖》西港附近水勢來看，這條新沖之溪，應是今日的七股溪。
新河道循著西港仔、含西港的港道，從西港南方、蠔売港北方，西流匯入港墘溪，與南邊的新浮埔溪、曾文溪，合沖出南七股的新生海埔地，圍出今日的七股潟湖內海。
當時府城右分水第一條為「德慶溪」，在水仔尾，今日成功路金安宮之後；第二條右分水則是「新港溪」，於柴頭港入海。新港溪於同治八年（1869年）改稱為鹽水溪。
府城第三條右分水為曾文溪，曾文溪自菅寮以下的河流地景，出現二叉，類似樹枝狀、蜿蜒河道，已進入淤積區，容易氾濫成災，形成洪氾平原。
曾文溪、新港溪下游的溪口、港道地景，道光三年之後，「鹿耳門」潮漲水只二、三尺，僅容竹筏往來，安平大港亦淤淺，小潮水深五、六尺，大潮深七、八尺。
道光廿二年（1842年）因為海漲暴作，郡城西門外鎮渡頭海口湧為沙洲，一片坦途直達安平。安平大港一路往南遷，這片沙洲溼地也一直西進，成為今日的五期重劃區、安平工業區。
資料來源：摘錄自吳茂成著《臺江內海及其庄社》
§台江十六寮
【台江十六寮】是台南市安南區的前身，且這個名詞的由來，是見證台江內海滄海桑田的最佳佐證。形成於古曾文溪和台南台地之間的海域「台江內海」，簡稱台江、或稱內海，是濱臨外海沙洲及陸地所圍成的潟湖，在台灣歷史發展上具舉足輕重的地位。在1626年福爾摩沙荷蘭人港口描述圖和清之方志，著有與台江內海相關之地形圖與文字敍述；如在1747（乾隆12年）重修臺灣府志（范志）中撰文為：「在縣治西門外。大海由鹿耳門入，各山溪之水匯聚於此。南至七鯤身，北至蕭壠、茅港尾」（卷一/封域/山川/臺灣縣）。台江內海外受黑潮支流由南向北及沿岸流影響，加上季風影響形成的沙丘，構成一個外洋與內海的世界。外洋是黑潮和海底地形所形成的強勁水流黑水溝。
台江浮覆陸化滄海桑田的大變遷是自西元1823年（清道光3年）7月，台灣大風大雨，帶來超豐沛水量，造成嚴重的土石流，河水挾著土石氾濫成災，及曾文溪（上游稱灣裡溪、下游名漚汪溪）數次的改道，造就了今日安南區大部分的土地，雖然土壤鹽分甚高，不利一般農作物生長，不過仍紛紛吸引墾民湧入搭寮建廟、築堤闢塭，使曾經汪洋浩瀚的台江內海，逐漸化為魚塭園田，隨著移民不斷的增加，開始出現了大小不一的聚落，這是由北而南、由東向西流動遷徒的「二次移民」，連帶將其原鄉宗教文化、族群認同等意識形態帶到了新墾地，而有「台江十六寮」的誕生，同時亦有「菅仔埔」之稱，因形成一片陸化海埔地，綠色先驅植物菅草、菅芒，會在此地先大量生長，菅芒花迎風搖曳時水煙土塞、水波不在，它亦是拓墾者搭建草寮的主要素材，故而安南區這一大片的新生地，菅仔埔是當時的代名詞。
台江十六寮包括的地區眾說紛云，所以台江十六寮以廣義而言是泛指今日的台南市安南區51里(見參考網址)。而較為民間流傳諺語中對台江十六寮之詮釋是：
「安身立命起草寮，台江出名十六寮，中洲、五塊、公親寮，和順、南路、陳卿寮，總理府衙溪頂寮，草湖、布袋嘴、新寮，總兵鎮守總頭寮，學甲、溪南、溪心寮，鹽田官衙本淵寮，大道公廟海尾寮」。
與1920年（日大正9年）的行政劃設雷同，七庄十六寮同屬台南州新豐郡安順庄:
和順寮庄（和順寮、五塊寮、中洲寮）、安順寮庄（溪頂寮、南路寮、陳卿寮、草湖寮、總頭寮、新寮、布袋嘴寮）、溪心寮庄（溪心寮）、海尾寮庄（海尾寮）、媽祖宮庄（本淵寮）、公親寮庄（公親寮）、學甲寮庄（溪南寮、學甲寮）。而土城區域三庄（土城仔庄、青草崙庄、十份塭庄）於當時是劃設為台南州北門郡七股庄，直到1938年（日昭和13年）土城區域三庄才劃入安順庄。
1945年（民國34年）臺灣光復，臺南州回復臺南縣(註 1)，新豐郡安順庄改為新豐區安順鄉。
1946年（民國35年）3月10日，安順鄉奉令劃歸臺南市管轄；為茲紀念，取安順之「安」與臺南之「南」，合稱為「安南」區。
目前台江內海縮小至現在的內海仔「七股潟湖」。所以七股潟湖是台江內海的最後僅剩的遺跡，位於曾文溪出海口處，外有沙汕青山港、網仔寮、頂頭額等與台灣海峽相隔，並與安南區之土城與四草建構了優質的水鳥生態環境景觀，現有掛牌於2009.12.28的台江國家公園為台江內海的歷史文化、地理變遷、生態保育持續傳承下去，無形中使台江十六寮之名詞也響亮起來在安南區中流傳著。
§細說台江
原住民考古期的台江
荷治時期的台江
清領時期的台江
東寧王時期的台江
日治時期的台江
戰後的台江